El 'Conejo' volvió a Barcelona tras su paso por el Principado con la intención de quedarse. Sin embargo, las cosas no fueron como le habían prometido antes de partir. El cuerpo técnico no contaba para nada con él, o quizá la directiva le había puesto la cruz por los desacuerdos económicos de antaño.

La cuestión es que el verano, como él mismo reconoció, no fue una situación muy agradable. Javier fue apartado del grupo hasta que aceptó una nueva cesión: esta vez al Sevilla FC.

El equipo andaluz había vendido a su gran estrella y necesitaba a un crack para la temporada de su Centenario. El elegido fue Saviola, y la afición lo recibió con los brazos abiertos. Desde el primer día se sintió como en casa, pues le gustó la ciudad, el proyecto del club y, sobretodo, un público apasionado que le recordaba al argentino.

En lo plenamente deportivo, le costó un poco arrancar. Volvió a notarse la falta de pretemporada, y no fue hasta noviembre que se estrenó en la Liga. Además, no le respetaron las lesiones. En su mejor momento, un esguince lo apartó de los terrenos de juego durante dos semanas. Y cuando volvía a estar en forma, una rotura de fibras lo volvió a sacar durante un mes. Pese a todo, tuvo un buen final de temporada, con 15 goles en total y siendo el máximo anotador del equipo. Dos de estos goles, en la última jornada (vs R. Madrid), estuvieron a punto de darles una merecida plaza para la Champions, pero finalmente el equipo quedó en 5º lugar, que daba acceso a la UEFA.

Fue un mal menor porque la gran alegría del sevillismo había llegado precisamente con la Copa de la UEFA, una competición donde se vio al mejor Saviola, que acabó marcando 6 goles y siendo, junto a Kanouté, el máximo goleador de la historia del Sevilla en competiciones europeas. Además, la UEFA lo nominó para el MVP del torneo (premio aún no decidido y al que aspiran también Maresca, Alves y Viduka).

El 10 de mayo, pues, el Sevilla FC se presentó en Eindhoven tras eliminar a Lokomotiv, Lille, Zenit y Schalke, y quedar primero en su liguilla. El rival, el Middlesbrough, nada pudo hacer ante un gran equipo que le endosó 4 goles. Los andaluces se proclamaron campeones 40 años después de su último título, y la fiesta se instaló en una Sevilla que, al ritmo del pegadizo "sevillista seré hasta la muerte..." salió a las calles para celebrarlo a lo grande. Como la ocasión merecía.

Javier Saviola, quién lo iba a decir, consiguió su primer título europeo tras dejar equipos como FC Barcelona y Mónaco, en teoría mucho más propensos a ganarlos. Maravillado por lo vivido, y con la firme intención de regresar, hizo las maletas para cumplir otro sueño: disputar un Mundial, competición para la cual había sido convocado por  Argentina.
 

Origen y primeros años | Su inicio en el fútbol: inferiores | El salto a Primera: River Plate
Ídolo en el Monumental | Campeón mundial sub'20 | Ficha por el FC Barcelona | Etapa azulgrana
Pibito en Mónaco | Campeón con el Sevilla